De início, eu não ia escrever essa seção. Quando comecei a estudar, não estudei nem li um guia de gramática de verdade, fui aprendendo por osmose e acabou dando certo. Mas como sugerido por @Umaigenomu, estudar o básico do básico da gramática no começo te ajuda a entender as coisas muito mais rápido. Olhando para trás, é verdade. Eu não precisaria ter ouvido várias horas de cada ponto de gramática até meu cérebro aprender tudo de tanto ouvir.
Mas não se engane, estudar gramática não é tão essencial quanto você pode estar pensando. Você não precisa decorar nenhum ponto de gramática, você só precisa entender o básico para ficar menos confuso quando começar a consumir conteúdo. Só isso.
Claro, quanto mais você estudar gramática, mais proveitoso vai ser o tempo que passar consumindo conteúdo, um dia escreverei um artigo sobre isso. Se eu pudesse voltar no tempo, faria isso!
Se você pensa que eu sou um idiota por te falar que para aprender uma língua você não precisa decorar pontos de gramática:
Explica aí, o que é pretérito imperfeito do subjuntivo? Se você é nativo, tenho certeza que vai saber me responder.
Não?
Tudo bem, então só me explica o que é pretérito perfeito composto, esse ta na ponta da língua que eu sei.
Também não? Pois é. Você provavelmente não sabe explicar nenhuma dessas regras e ainda por cima nem se lembra sobre o que se trata, é normal. Isso não te impede de usar elas diariamente e escrever da forma correta. Você sabe gramática porque escutou português a sua vida inteira. Não precisa ficar juntando peças de lego na sua cabeça toda vez que vai montar uma frase, você simplesmente sabe o que esta certo e o que está errado só de ouvir. Mesmo que não saiba exatamente o porquê, você sabe e consegue consertar.
Com japonês vai ser a mesma coisa, então não se preocupe em ficar marretando gramática na sua cabeça por horas e horas.
Recomendo que leia o guia do Tae Kim que foi gentilmente traduzido pelo pessoal do Japão Pop
Se por qualquer motivo não gostar do Tae Kim, sinta-se a vontade para estudar o básico de gramática do jeito que quiser. Livros, Youtube, você que manda.
Criar cards no Anki para os pontos de gramática também é uma opção, você que sabe.
Não se apegue muito e vá na fé.